Генрих III родился 1 октября 1207 года в Уинчестерском замке. Он был старшим сыном короля Иоанна Безземельного и Изабеллы Ангулемской. О его детстве известно немного, но, судя по всему, он был близок к своей матери. Его образование было поручено епископу Пьеру де Рошу, под руководством которого он обучился верховой езде и военному делу. Современники описывали Генриха как «добродушного, спокойного и симпатичного» человека, который отличался искренностью и сильной религиозностью.
К моменту смерти отца 19 октября 1216 года девятилетний Генрих находился под охраной в одном из замков. Гражданская война, начавшаяся при Иоанне из-за его тирании, продолжалась, и большая часть Англии была занята французским принцем Людовиком. Чтобы спасти страну, глава роялистов, Уильям Маршал, 1-й граф Пембрук, срочно направился к Генриху.
28 октября 1216 года в Глостере, в аббатстве Святого Петра, состоялась поспешная коронация мальчика. Для этого королевские одежды пришлось обрезать, а вместо короны использовали тонкий золотой обруч. Генрих поклялся быть вассалом римского папы, и на следующий день регентом при нём был избран Уильям Маршал, принявший титул «стража короля и королевства».
В первые годы своего правления, под руководством мудрого Уильяма Маршала, правительство Генриха III предприняло решительные шаги для прекращения гражданской войны. Была издана переработанная Великая хартия вольностей, которая, в отличие от первой, была более предметной и исключала пункты, ограничивающие власть короля. Эта версия получила название Великой хартии 1217 года.
Военные действия возобновились в мае 1217 года. Войска Уильяма Маршала одержали решающую победу над французами в битве при Линкольне, а затем королевский флот под командованием Хьюберта де Бурга разгромил французский флот в битве при Сэндвиче. Эти победы вынудили Людовика Французского подписать Ламбетский договор и покинуть Англию. Гражданская война была окончена.
После этого правительство приступило к восстановлению королевской администрации и судебной системы. В 1219 году Уильям Маршал умер, и фактическое управление страной перешло к Хьюберту де Бургу, главному юстициарию. В 1225 году была переиздана Великая хартия вольностей, получившая свою окончательную редакцию, а архиепископ Стефан Лэнгтон пригрозил отлучением от церкви всем, кто осмелится нарушить её положения.
В 1227 году Генрих III объявил себя способным править самостоятельно, отстранив своего опекуна Пьера де Роша. С этого момента начались финансовые трудности, так как король, будучи вассалом папы, был вынужден платить Риму высокую дань. Кроме того, папа жаловал многие церковные должности в Англии иностранцам, что вызывало недовольство знати.
Противостояние с баронами усугубилось, когда Генрих стал окружать себя иностранцами, так называемыми «савоярами», из свиты своей жены, Элеоноры Прованской, на которой он женился в 1236 году. Это вызвало возмущение англо-нормандской знати, которая считала, что король пренебрегает их интересами.
Лидером оппозиции стал Симон де Монфор, 6-й граф Лестер, который был женат на сестре короля Элеоноре. Конфликт обострился в 1239 году, когда Генрих неожиданно поссорился с Симоном де Монфором из-за финансовых операций. Симон и его жена были вынуждены покинуть Англию.
Постоянные финансовые проблемы короля, вызванные его расточительностью и обязательствами перед Римом, привели к росту налогов и насильственным поборам с евреев. В 1258 году бароны, возглавляемые Симоном де Монфором, собрали войско и вынудили короля принять Оксфордские провизии, которые создавали государственный совет из 15 человек, контролирующий действия монарха.
Началась вторая в истории Англии баронская война. Армия Симона де Монфора одержала решительную победу над войсками короля и его сына Эдуарда в битве при Льюисе в 1264 году. Генрих и его сын попали в плен. Симон де Монфор, ставший фактическим правителем, созвал в 1265 году парламент, в который, помимо баронов и высшего духовенства, впервые были приглашены представители городов. Этот парламент считается «зародышем» будущей Палаты общин.
Однако принц Эдуард сумел бежать из плена и в 1265 году в битве при Ившеме разгромил армию Симона де Монфора, который погиб в бою. Война продолжалась ещё несколько лет, но Эдуард постепенно усмирил мятежников, а в 1267 году был подписан Статут Мальборо, который подтвердил права, закреплённые в Оксфордских провизиях.
Генрих III скончался 16 ноября 1272 года. Его тело было временно захоронено в гробнице Эдуарда Исповедника в Вестминстерском аббатстве, которое было перестроено в готическом стиле при его правлении. Позже его останки были перенесены в отдельную усыпальницу.
