Птолемей VI Филометордун башкаруусу эллинисттик Египет тарыхындагы эң драмалуу жана окуяларга бай барактардын бири болуп саналат; ал тышкы согуштар жана ички тирештер менен гана эмес, Римдин Чыгыш иштерине болуп көрбөгөндөй кийлигишүүсү менен да белгиленген. Птолемей V Эпифандын жана сириялык падыша Антиох IIIтүн кызы Клеопатра Iдин улуу уулу болгон жаш мураскер атасынын капысынан өлгөндөн кийин тактыга жаш курагында отурган. Анын башкаруусунун алгачкы мезгили энеси Клеопатра Iдин акылман регенттиги астында өтүп, ал Рим менен достук мамилелерди сактоо жана маркум жолдошунун согушчул пландарына карабастан Селевкиддер менен ачык кагылыштан качуу аркылуу өлкөдө тынчтыкты камсыз кыла алган.
Бирок бул туруктуулук мезгили ханышанын күтүүсүз өлүмү менен үзүлүп, ал таасирдүү мураскерлерди дайындай албай калган. Александрияда бийликти амбициялуу убактылуу башкаруучулар — Хузестандан чыккан болушу мүмкүн евнух Евлей жана сириялык Леней басып алышкан. Өз позицияларын бекемдөөгө жана Римдин кийлигишүүсүнөн качууга умтулган бул мурдагы кулдар Птолемей VIны шашылыш түрдө эрезеге жетти деп жарыялашкан; ошол учурда ал болгону он беш жашка жаңы толгон эле. Расмий азем — анаклетерия б.з.ч. 172-жылы болуп өтүп, бул Рим жана Сирия элчилеринин «достукту жаңыртуу» максатындагы сапарына себеп болгон. Дал ушул мезгилде падышага Филометор («Энесин сүйгөн») деген лакап ат бекитилип, анын Клеопатра I менен терең байланышын жана анын жашоосундагы ролун баса белгилеген.
Иштердин тынч агымы регенттердин авантюристтик саясаты менен бузулуп, алар Египетке Келесирияны кайтарып берүүнү чечишкен. Бул сириялык падыша Антиох IV Эпифанга алдын ала сокку урууга шылтоо берген. Рим Македония падышасы Персей менен согушка алаксып турган учурда, Антиох б.з.ч. 170-жылы египеттик аскер чөлдөн өтүп үлгүрө электе эле аны талкалаган. Аскердик айла же келишимди бузуу аркылуу стратегиялык маанилүү Пелусийди басып алып, Антиох Александр Македонскийден бери биринчи жолу Египеттин ичине кирип, Мемфисти ээлеген. Птолемей VI Евлейдин кеңеши менен ыйык Самофракия аралына качууга аракет кылган, бирок агасы Антиох тарабынан туткунга алынып, ал аны жасалма жылуу мамиле менен кабыл алган. Тыйындардын табылгалары менен тастыкталган маалыматтарга караганда, Мемфисте Антиох фараон катары таажы кийген болушу мүмкүн, бирок тарыхчылар мунун олуттуу саясий кадамбы же эксцентрик сириялык падышанын каалоосубу деген маселе боюнча талашышат.
Ошол эле учурда Александрияда көтөрүлүш чыгып, эл жек көргөн убактылуу башкаруучуларды кулатып, туткундалган падышанын кичүү инисин такка отургузган; ал кийин Птолемей VIII Эвергет II деген ат менен белгилүү болгон. Ошентип Египетте кош бийлик пайда болгон. Антиох IV бекемделген Александрияны штурм кылбоону чечип, өлкөнү бөлүнгөн абалда калтырган: Филометор Мемфисте анын протектораты астында, ал эми Эвергет Александрияда башкарган. Бирок бир туугандар, сыягы, карындашы Клеопатранын ортомчулугу менен, тез эле тил табышып, биргелешкен башкаруу жөнүндө келишим түзүшкөн. Бул биригүү б.з.ч. 168-жылы Антиохтун кайрадан басып киришине себеп болгон. Анын флоту Кипрди басып алып, өзү дагы Александрияга карай жүрүш жасаган.
Куткаруу Римден келген. Пиднадагы салгылаштагы жеңиштен кийин (б.з.ч. 168-жылдын 22-июну) сенат Египетке Гай Попиллий Ленатты жөнөткөн. Александриянын четинде болгон белгилүү окуяда римдик Антиохтун айланасына таяк менен тегерек сызып, ал бул чектен аттаганга чейин аскерлерди чыгарып кетүү жөнүндө жооп берүүсүн талап кылган. Римдин күчүнөн корккон Антиох Египетти жана Кипрди таштап кетүүгө мажбур болгон. Кийинки беш жыл ичинде бир туугандар биргелешип башкарган, бирок алардын союзуна интригалар жана мүнөздөрүнүн терең айырмасы тоскоолдук кылган. Полибийдин сүрөттөөсүнө караганда, Птолемей VI Филометор жумшак, адамгерчиликтүү жана компромисске жакын башкаруучу болгон. Анын иниси болсо тескерисинче, катаал жана бийликке умтулган адам болгон. Ички тирештер Дионисий-Петосарапис сыяктуу көтөрүлүштөр менен күчөгөн; ал бир туугандарды бири-бирине каршы коюуга жана египеттик калкты грек үстөмдүгүнө каршы көтөрүүгө аракет кылган.
Б.з.ч. 164-жылы Птолемей VI иниси тарабынан куулуп, Римге качкан. Анын сапары атайын жөнөкөйлүк менен уюштурулган: падыша жөө жүрүп, кедей саякатчынын кийимин кийип, сенаттын боорукерлигин жаратуу үчүн жөнөкөй боёкчунун үйүндө жашаган. Рим сенаты бир туугандардын ээликтерин бөлүштүрүү чечимин кабыл алган: Филометор Египетти жана Кипрди, ал эми Эвергет Киренаиканы алган. Көп өтпөй александриялыктар кичүү инисинин тираниясына чыдабай, Филометорду кайра чакырышкан. Б.з.ч. 163-жылдан тартып ал Египеттин жалгыз башкаруучусу болуп, расмий титулуна жубайы Клеопатранын ысымын кошкон.
Тынч мезгил активдүү курулуш иштери менен белгиленген: падыша Мемфистеги жана Филы аралындагы храмдарды зыярат кылып, Эдфудагы дарбазаларды бүтүрүп, Карнактагы жана Эснадагы ыйык жайларды кооздоткон. Птолемейлердин сарайы түштүк багытында да активдүү саясат жүргүзүп, Нилдин экинчи босоголоруна чейин илгерилеген. Бирок иниси менен кастык токтогон эмес. Птолемей Эвергет сенаттагы айрым топтордун колдоосуна ээ болуп, Кипрди өткөрүп берүүнү талап кылган. Чыр-чатак б.з.ч. 154-жылы туу чокусуна жетип, Филометор Кипрде инисин туткунга алган, бирок таң каларлык айкөлдүк көрсөтүп, аны кечирип гана тим болбостон Киренаикадагы бийлигин тастыктап, ага буудай жеткирүүнү жана өз кызынын колун убада кылган. Бул асылдыгы үчүн Марк Порций Катон Улук сенатта аны «эң мыкты жана эң кайрымдуу падыша» деп атаган.
Птолемей VIнын өмүрүнүн акыркы жылдары Сириядагы таасир үчүн күрөш менен байланышкан. Алгач ал Деметрий Iге каршы талапкер Александр Баласты колдоп, кызы Клеопатра Теаны ага турмушка берген. Бирок көп өтпөй Александрдан көңүлү калып жана өзүнө каршы кол салуу даярдалып жатканын билип, Птолемей жаш Деметрий IIнин тарабына өткөн. Антиохиянын тургундары Птолемейдин адилеттүүлүгүнө ушунчалык суктангандыктан, ага Сириянын таажысын сунушташкан, бирок ал Римди ачуулантпоону каалап, баш тарткан жана алардын Деметрийди кабыл алышына көндүргөн.
Бул окуянын акыркы актысы б.з.ч. 145-жылы Энопор дарыясындагы салгылашта болгон. Александр Балас жеңилген, бирок Птолемей VI өлүмгө алып келген жараат алган: анын аты пилдин күркүрөгөн үнүнөн чочуп, падышаны жерге ыргытып жиберген, андан соң душмандары анын башына көптөгөн жарааттарды салышкан. Ал беш күн бою эс-учун жоготкон абалда жатып, дарыгерлердин колунда каза болгон; өлөр алдында душманы Александардын кесилген башын көрүүгө үлгүргөн. Птолемей VI Филометор болжол менен 42 жашында, башкаруусунун 36-жылынын соңунда көз жумган.
